Whole genome analysis to detect potential vaccine-induced changes on Shigella sonnei genome

Shigellosis or bacillary dysentery is endemic worldwide and is a significant cause of death in children less than five years of age in developing countries. There are no licensed Shigella vaccines and glycoconjugates are among the leading candidate vaccines against shigellosis today.We used whole genome sequence analysis (WGA) to find out whether immunization, with an investigational Shigella sonnei glycoconjugate, could induce selective pressure leading to changes in the genome of S. sonnei. An outbreak of culture-proven S. sonnei shigellosis which occurred immediately after vaccination in one of the cohorts of volunteers participating in a phase III trial of the vaccine in Israel created a unique condition in which the epidemic agent “co-existed” with the developing immune responses induced by the vaccine and natural infection among vaccinees who developed S. sonnei shigellosis. By comparing the whole genomes of S. sonnei isolated from vaccinees and from volunteers in the control group, we show at a very high sensitivity that a potent S. sonnei glycoconjugate that conferred 74% protective efficacy against the homologous disease did not induce changes in the genome of S. sonnei and in particular on the O-antigen gene cluster.     

2017-2021年黑龙江省肺结核合并糖尿病登记率及变化趋势

目的 了解黑龙江省肺结核合并糖尿病登记率及变化趋势,为今后制定相应防治政策提供依据。方法 通过《结核病信息管理系统》收集黑龙江省2017—2021年肺结核合并糖尿病患者信息资料,采用描述流行病学方法分析患者一般人口学特征、患者来源、治疗分类、病原学诊断、药敏试验结果等,应用Jointpoint回归模型分析黑龙江省及其13个行政地级市（地区）肺结核合并糖尿病年登记率的变化趋势。结果 2017—2021年黑龙江省共登记肺结核合并糖尿病患者5 816例（年均登记率3.31/10万）,年登记率从2017年的2.22/10万上升至2021年的4.65/10万,年度变化百分比（APC）呈上升趋势（APC=17.01%,95%CI:4.45%～31.08%,t=4.401,P=0.022）;13个行政地级市（地区）中哈尔滨市呈上升趋势（APC=23.85%,95%CI:18.83%～29.14%,t=16.387,P<0.01）,伊春市呈下降趋势（APC=-81.04%,95%CI：-94.19%～-37.24%,t=-4.428,P=0.021）,其他地市年登记率变化趋势差异无统计学意义（P...     

2014－2016年全国其他感染性腹泻突发公共卫生事件流行特征分析

目的了解我国除霍乱、痢疾、伤寒/副伤寒之外的其他感染性腹泻突发公共卫生事件的发生规律和特点,探讨其空间聚集性,为识别重点防控方向提供依据。方法 采用描述性流行病学方法对2014－2016年全国其他感染性腹泻突发公共卫生事件数据进行分析,应用ArcGIS 10.5软件空间统计模块进行空间自相关分析并绘制地图。结果 2014－2016年全国共报告除霍乱、痢疾、伤寒/副伤寒之外其他感染性腹泻突发公共卫生事件332起,累计报告病例17 130例,无死亡病例。 11月至次年3月是高发期。 86.14%的事件由诺如病毒感染引起。 事件发生原因包括生活接触传播、食品污染和饮用水污染。 其他感染性腹泻事件空间上呈明显地域化分布,报告省份均集中在我国东部,并呈空间聚集性特点,热点地区集中在广东省、广西壮族自治区（广西）和福建省。结论我国目前除霍乱、痢疾、伤寒/副伤寒之外其他感染性腹泻突发公共卫生事件主要以诺如病毒感染事件为主,做好重点人群的健康教育和学校等重点场所的监督管理,加强饮水卫生、食品安全监测和管理工作,是有效控制事件发生的主要措施。 建议相关部门将高发病的广东省、广西和福建省等热点区域作为重点防治地区,进一步探索导致区域聚集性的原因和机制,采取有效防控措施,减少其他感染性腹泻事件的发生。     

青海省农牧地区医疗机构梅毒诊断能力调查及影响因素分析

目的 调查青海省农牧地区医疗机构梅毒诊断能力并分析影响因素.方法 随机抽取3个农业区和3个牧区对其所有梅毒报卡医疗机构开展调查,每个机构至少30例,调查内容包括对梅毒诊断正确性的核实、临床诊断医生、实验室人员相关情况及实验室检测能力等.结果 调查农牧区梅毒报告正确率为94.17％(农业区为95.20％、牧区为93.58...     

中国老年人代谢综合征流行特征及其影响因素研究

目的 探讨我国≥ 60岁老年人群MS流行特征及其影响因素,为其防控工作提供科学依据。方法 数据来自2013年中国慢性病及其危险因素监测。采用多阶段分层整群抽样的方法对31个省（自治区、直辖市）的298个监测县（区）辖区内人群进行抽样,将其中50 497名≥ 60岁老年人作为研究对象。根据2017年中华医学会糖尿病分会提出的中国人的MS诊断标准,比较MS不同分组间患病率的差异,分析MS与主要影响因素的关联性。结果 我国老年人MS患病率为36.9%（95% CI：35.4~38.5）,城市高于农村,女性高于男性,东部地区高于西部地区。≥ 70岁老年人MS患病率低于60~69岁老年人。高文化程度、高家庭收入的老年人群MS患病率高于低社会经济水平的老年人群。MS各组分患病率比较显示,高血压的患病率最高,为72.8%,其次为高血糖和中心性肥胖。年龄、性别、文化程度、地区和城乡是MS的主要影响因素,吸烟、饮酒和身体活动水平与MS具有相关性。结论 我国老年人群中,女性MS患病风险高于男性,MS患病风险与社会经济水平和生活行为因素有关。建议对MS患病人群开展以增加运动和合理膳食为主的生活方式干预,高血压和高血糖患者在生活方式干预基础上需进行药物治疗,降低心血管疾病的发病和死亡风险。     

中国流感大流行的百年历史

流感大流行在过去100年间出现过5次（1918年"西班牙流感"、1957年"亚洲流感"、1968年"香港流感"、1977年"俄罗斯流感"和2009年甲型H1N1流感）,累计数亿人感染和数千万人死亡。历史文献表明5次大流行均波及我国多个地区,产生了较大规模的影响,其中1957、1968和1977年流感大流行被认为是从我国开始暴发。流感大流行直接促使我国设立公共卫生机构和流感专业部门,并在科学研究与疫情防控上加大投入。我国应当进一步加强流感大流行的准备与应对,承担流感领域领导者的责任,为全球健康作出贡献。     

2018年《北京市控制吸烟条例》在东城、朝阳区餐馆实施效果调查

目的 评估《北京市控制吸烟条例》（《条例》）实施效果。方法 2018年4月通过分层阶段抽样方法,选择北京市东城、朝阳区93家餐馆,在午餐和晚餐时间进行暗访随访,观察餐馆内吸烟现象,并与实施前半年、实施1个月的结果进行比较。结果 餐馆禁烟标识张贴率（76.3%）和服务员对《条例》整体认知程度均较高。总体吸烟发生率（29.0%）低于实施前半年的吸烟率（36.7%）,高于实施1个月的吸烟率（14.8%）。未发现服务员主动劝阻行为。商业建筑内餐馆吸烟发生率（3.3%）低于非商业建筑内餐馆（41.3%）,差异有统计学意义（P<0.05）。结论 《条例》实施效果低于实施1个月。禁烟标识张贴率和服务员认知水平与法规实际遵守情况相背离。应加强对餐馆经营者和公众的宣传和教育。     

我国2015－2016年哨点监测手足口病病原学和并发症分析

目的 分析2015－2016年我国手足口病哨点监测系统的手足口病特征,探讨建立手足口病哨点监测的可行性、优势及不足。方法 数据来源于11个国家级哨点监测点2015年11月至2016年10月手足口病监测数据,描述手足口病的病原特征、代表性和重症病例并发症情况,采用多因素logistic回归分析手足口病哨点监测样本阳性率的相关影响因素。采用SPSS 20.0软件进行统计学分析。结果 共有4 783例手足口病病例样本,其中轻症病例3 390例,重症病例1 390例,死亡3例。肠道病毒（EV）阳性率为81.43%（3 895/4 783）,轻症病例优势血清型为其他EV（52.68%,1 482/2 813）,重症病例优势血清型为EV71（65.31%,706/1 081）。哨点监测显示的优势血清型与同时期现有监测血清型基本一致。其他EV所致病例中低年龄组儿童所占比例高于EV71和柯萨奇病毒A组16型（Cox A16）（χ²=130.17,P<0.001）。多因素logistic回归结果显示,样本阳性率高与男性、高发月份病例、儿童医院病例、样本为粪便、及时采样有关。不同类型样本阳性率均呈现随发病-采样间隔时间的延长而下降的趋势（粪便趋势χ²=14.47,P<0.001;咽拭子趋势χ²=31.99,P<0.001;肛拭子趋势χ²=24.26,P<0.001）。无菌性脑膜炎、非脑干脑炎、脑干脑炎为重症病例最常见的3种并发症,EV71和其他EV所致重症病例并发症差异无统计学意义。结论 哨点监测发现性别、发病月份、接诊医院类别、标本类型、采样及时性是影响手足口病样本阳性率的5个独立影响因素。哨点监测可以收集这些影响因素以提升监测质量。设立手足口病国家级哨点监测在我国是可行的。     

一起聚餐所致O139霍乱疫情和甲鱼市场调查

目的通过一起O139霍乱疫情调查,分析发病原因,为霍乱防控提供科学依据。方法建立病例定义,开展病例搜索、卫生学调查和实验室检测。提出假设,开展回顾性队列研究,确定危险因素。结果 2名霍乱病例全部为午餐就餐者,罹患率3.4%。流行病学调查支持点源暴露的流行模式,食用哈密瓜是危险因素(RR=+∞,P<0.05)。该餐同批次"温水甲鱼"中检测出与病人同源O139霍乱弧菌。聚餐饭店食品加工器具生熟不分,存在交叉污染。碱性且不消毒的自备井水、湿热的环境和富含营养的食品为霍乱弧菌增殖适宜的条件。结论本次霍乱疫情是聚餐所致,带菌甲鱼通过食品加工器具污染了生食的水果是导致疾病的原因,提示需要认真做好农村聚餐及餐饮从业人员的监督管理,加强甲鱼等水产品市场管理和监测;不同品种的甲鱼带菌情况可能不同,采样检测时应注意区分品种;当地乡镇、农村自备井水在夏秋肠道病多发季节应开展消毒处理,减少疫情发生。     

SARIMA-GRNN组合模型和SARIMA模型在流行性腮腺炎发病率预测中的应用

目的 探讨SARIMA-GRNN组合模型和SARIMA模型在流行性腮腺炎发病率预测中的应用,并对他们的预测效果进行比较.方法 选取2004-2016年上海市流行性腮腺炎逐月发病率资料,基于2004年1月-2016年6月的数据建立SARIMA模型.利用2004-2015年流行性腮腺炎的SARIMA模型拟合值与实际值、时间...